序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
医津一筏
内外伤辨惑论
验方家秘
序小引揉积论综概晒说跋
原序潘序周序十药总论甲字十灰散乙字花蕊石散甲乙二方论丙字独参汤丙字人参汤论丁字保和汤戊字保真汤丁戊二汤方论己字太平丸己字太平丸论庚字沉香消化丸庚字消化丸论辛字润肺膏辛字润肺膏论壬字白凤膏癸字补髓丹平胃
序凡例九针式卷一难经一、补泻二、补泻相反三、针刺浅深四、先后浅深五、井荥俞经合主病六、四时井荥俞经合刺七、脏腑荥俞合皆以井为始八、脏腑井荥为五六九、阴阳井荥木金相生不同十、出井入合十一、欲刺井当刺荥十
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
原序附刊丹方补遗序自序凡例贸药辨真假诸症歌诀单方经验丹方汇编中风预防中风风气痛（附痿症、脱颏）虚劳血证肿胀反胃噎膈痰饮咳嗽梦遗白浊伤寒瘟疫（附冒风寒方）疟疾痢疾肠风下血便血淋漓并小便闭塞霍乱吐泻（附痧
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙