卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
张序卷上卷下跋
萧序范序朱序何序卷一医工论禀受论初生论回气论洗浴论断脐论相视寿夭论初生服药论中寒论初生不乳论脐风撮口论胎中病论诸不治病卷二五气论心肝脾肺肾乳母论慎护论食忌论大小论诸般色泽纹证论诸色泽候诸处纹状候五脏主
叙静功静功妙药醒语静功妙药八懿静功妙药前珍静功妙药九种闭息导引八段锦八段锦诗十六字三字六字十二字七返九还袁了凡静功诀纪验纪验二刻
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
自叙卷一草部苍术黄精益智仁草豆蔻缩砂仁补骨脂肉豆蔻胡芦巴白豆蔻红豆蔻大茴香香附荜拨藿香香薷荜澄茄使君子威灵仙白附子慈菰牵牛子何首乌肉苁蓉锁阳丹参泽兰益母草刘寄奴延胡索胭脂（艹/閶）茹姜黄地榆三七蒲黄续
序一序二集解序卷上诊候入式歌五脏歌心脏歌一心脏歌二心脏歌三肝脏歌一肝脏歌二肝脏歌三脾脏歌一脾脏歌二脾脏歌三肺脏歌一肺脏歌二肺脏歌三肾脏歌一肾脏歌二肾脏歌三左右手分诊五脏四时脉歌左手寸口心脉歌左手关部肝
类中肝风眩晕头痛咳嗽吐血失音肺痿虚劳遗精淋浊尿血小便闭癃
卷上论疮肿诊候入式法论荣卫色脉参应之法论持手诀消息法论三部所主脏腑病证论脉证名状二十六种所主病证论三部脉所主证候论三部脉所主杂病法诀论诊候肺疽肺痿法论将护忌慎法论疮疽肿虚实法辨疮肿浅深法辨脓法辨疮疽疖
序凡例运气流行法小儿病源总论辨实热辨虚热胎热预治方初生危证惊风之候丹毒之候腹痛之候杂证三关脉法观形察色法听声音法胎热急惊慢惊慢脾风天吊客忤中恶痉痫癫狂丹毒遍身胎肿瘰瘿瘤腹痛腹胀吐泻脱肛下疳疮痔疾治方大